SCImago Institutions Ranking (SIR) เป็น การจัดอันดับสถาบันที่มีผลงานวิจัยในระดับนานาชาติ ซึ่งจะไม่ได้นับเฉพาะมหาวิทยาลัย แต่จะนับรวมสถาบันเฉพาะทางด้วย เช่น สถาบันเทคโนโลยี วิทยาลัย โรงพยาบาล สถาบันวิจัย เป็นต้น ซึ่งเป็นการจัดอันดับมหาวิทยาลัยรวมทั้งสถาบันวิจัยในแง่ของความสามารถในการเผยแพร่ผลงานวิชาการทุกประเภทของสถาบัน หรือมหาวิทยาลัยบนฐานข้อมูล Scopus
| อันดับปี 2009 | มหาวิทยาลัย | อันดับปี 2008 |
|---|---|---|
| 592 | มหาวิทยาลัยมหิดล | |
| 608 | จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย | |
| 619 | สถาบันเทคโนโลยีแห่งเอเชีย | |
| 666 | มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี | |
| 669 | มหาวิทยาลัยนเรศวร | |
| 682 | มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ | |
| 689 | มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี | |
| 706 | มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ | |
| 711 | มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ | |
| 724 | มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ | |
| 735 | มหาวิทยาลัยขอนแก่น | |
| 764 | สถาบันเทคโนโลยีพระจอมเกล้าเจ้าคุณทหารลาดกระบัง |