SCImago Institutions Ranking (SIR) เป็น การจัดอันดับสถาบันที่มีผลงานวิจัยในระดับนานาชาติ ซึ่งจะไม่ได้นับเฉพาะมหาวิทยาลัย แต่จะนับรวมสถาบันเฉพาะทางด้วย เช่น สถาบันเทคโนโลยี วิทยาลัย โรงพยาบาล สถาบันวิจัย เป็นต้น ซึ่งเป็นการจัดอันดับมหาวิทยาลัยรวมทั้งสถาบันวิจัยในแง่ของความสามารถในการเผยแพร่ผลงานวิชาการทุกประเภทของสถาบัน หรือมหาวิทยาลัยบนฐานข้อมูล Scopus
| อันดับปี 2013 | มหาวิทยาลัย | อันดับปี 2012 |
|---|---|---|
| 487 | จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย | 522 |
| 496 | มหาวิทยาลัยมหิดล | 532 |
| 576 | มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ | 626 |
| 577 | มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี | 609 |
| 595 | มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ | 644 |
| 601 | สถาบันเทคโนโลยีแห่งเอเชีย | 624 |
| 602 | มหาวิทยาลัยขอนแก่น | 652 |
| 606 | มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ | 653 |
| 619 | มหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวง | |
| 627 | มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี | 672 |
| 627 | มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ | 670 |
| 629 | มหาวิทยาลัยนเรศวร | 638 |
| 633 | มหาวิทยาลัยศิลปากร | 651 |
| 635 | สถาบันเทคโนโลยีพระจอมเกล้าเจ้าคุณทหารลาดกระบัง | 676 |
| 644 | มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ | 680 |
| 678 | มหาวิทยาลัยมหาสารคาม | 727 |